RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 GIPC2Q8TF65 315 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 RUBCNQ92622 972 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DHX58Q96C10 678 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 UBE4BO95155 1302 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF233A6NK53 670 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SOBPA7XYQ1 873 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DPYSL4O14531 572 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ASIC1P78348 528 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PLCB2Q00722 1185 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 MYL7Q01449 175 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.38■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 F11P03951 625 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 KRT19P08727 400 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CSH1P0DML2 217 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CSH2P0DML3 217 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CTHP32929 405 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 LHX1P48742 406 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP12P59046 1061 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TAF12Q16514 161 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DPH6Q7L8W6 267 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 OSTM1Q86WC4 334 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 EPC1Q9H2F5 836 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 OBSL1O75147 1896 aa22.37■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TGFB1I1O43294 461 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 NOL4O94818 638 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 F13A1P00488 732 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PCSK1P29120 753 aa22.36■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 CCR3P51677 355 aa22.36■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 TSSK4Q6SA08 328 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 UNC13DQ70J99 1090 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 WDR49Q8IV35 697 aa22.36■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.36■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TNNC2P02585 160 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SOX9P48436 509 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 MYO1EQ12965 1108 aa22.35■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 GAS6Q14393 721 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R5DQ14738 602 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 WDR44Q5JSH3 913 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 MYRFLQ96LU7 910 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.35■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.35■■□□□ 1.17
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UBXN4-204ENST00000426921 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 TADA3O75528 432 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CYP2F1P24903 491 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 ID4P47928 161 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FOXK2Q01167 660 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC142Q17RM4 750 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 RESP18Q5W5W9 173 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 FAM171BQ6P995 826 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.34■■□□□ 1.17
UBXN4-204ENST00000426921 HPDLQ96IR7 371 aa22.34■■□□□ 1.17
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