RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TPST1O60507 370 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CORO7P57737 925 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STX5Q13190 355 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM69Q86WT6 500 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RBBP8Q99708 897 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB14A6NK59 587 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STK25O00506 426 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MTSS1O43312 755 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ARIH2O95376 493 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT75O95678 551 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CYBBP04839 570 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPDH2P12268 514 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK10P57789 538 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPPQ6IPU0 288 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TADA1Q96BN2 335 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPIND1P05546 499 aa11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MPP6Q9NZW5 540 aa11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.46□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP99D6REC4 459 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TOMM70O94826 608 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DRAP01903 254 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 COPAP53621 1224 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP107P57740 925 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM143Q96AN5 459 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM118BQ9BPY3 351 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NOD2Q9HC29 1040 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAP2O75791 330 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PTGER2P43116 358 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPCQ03188 943 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH9Q5TGP6 573 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf22Q6V702 233 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HDDC2Q7Z4H3 204 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 WNK4Q96J92 1243 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB12Q96P63 405 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP19Q99542 508 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 BBS2Q9BXC9 721 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PDP2Q9P2J9 529 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT3Q9UH03 358 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PQJ5 194 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 E7ENQ6 273 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKIO75912 1065 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIK1P39086 918 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CHI3L2Q15782 390 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM162AQ96A26 154 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD5Q96G74 571 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CNBD2Q96M20 576 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CD274Q9NZQ7 290 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PLAGL2Q9UPG8 496 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIA6Q15084 440 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC142Q17RM4 750 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SYTL3Q4VX76 610 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBGCP3Q96CW5 907 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFB10O96000 172 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 PDGFRBP09619 1106 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 ADRA2BP18089 450 aa11.44□□□□□ -0.58
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42EP1Q00587 391 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms