RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 INSL6Q9Y581 213 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 AATKQ6ZMQ8 1374 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MAST3O60307 1309 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CDHR4A6H8M9 788 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 F8W8V4 182 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 SLC43A1O75387 559 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 BRAFP15056 766 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TSHRP16473 764 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TNFSF4P23510 183 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SLC6A4P31645 630 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SOX8P57073 446 aa3.54□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 SCAPQ12770 1279 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DAG1Q14118 895 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 KIF22Q14807 665 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC93Q567U6 631 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PRR16Q569H4 304 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SESTD1Q86VW0 696 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SKAP1Q86WV1 359 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 COLGALT2Q8IYK4 626 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 VPS37AQ8NEZ2 397 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PNKPQ96T60 521 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 DPH1Q9BZG8 443 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CASS4Q9NQ75 786 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RLIMQ9NVW2 624 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PADI4Q9UM07 663 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MED16Q9Y2X0 877 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 POM121BA6NF01 834 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 NCK2O43639 380 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TCEA3O75764 348 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 HAUS5O94927 633 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 IL18RAPO95256 599 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRC-207ENST00000418674 STT3AP46977 705 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 STK3Q13188 491 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CYP2A13Q16696 494 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 FAM209BQ5JX69 171 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 Q6ZNX1 250 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 RNF152Q8N8N0 203 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D15Q8TC07 691 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CAGE1Q8TC20 777 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MAML1Q92585 1016 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 MED15Q96RN5 788 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PACSIN1Q9BY11 444 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 SLAMF7Q9NQ25 335 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 JKAMPQ9P055 326 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 COL20A1Q9P218 1284 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC78A2IDD5 438 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-207ENST00000418674 MYADML2A6NDP7 307 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 F5H423 210 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CREB3O43889 395 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 GJB1P08034 283 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 GNAI3P08754 354 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PLA2G5P39877 138 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PHKA1P46020 1223 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 TRAPPC10P48553 1259 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 VAV2P52735 878 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 GNAI1P63096 354 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 NOMO3P69849 1222 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 C4orf46Q504U0 113 aa3.52□□□□□ -1.85
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