RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA8SH3BPF8 625 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 I3L4J1 428 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SPOPO43791 374 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ERBB2P04626 1255 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 UPP1Q16831 310 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TCTN1Q2MV58 587 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 UNC93AQ86WB7 457 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TTC30AQ86WT1 665 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PGBD4Q96DM1 585 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SENP8Q96LD8 212 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PNKPQ96T60 521 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SNX25Q9H3E2 840 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.26■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC130P13994 396 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RGS7P49802 495 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 OGDHQ02218 1023 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 C18orf8Q96DM3 657 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SCLYQ96I15 445 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ST7Q9NRC1 585 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RNF14Q9UBS8 474 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 F8W810 466 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CES2O00748 559 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ADORA2BP29275 332 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 FAM189BP81408 668 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 XYLT1Q86Y38 959 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MCEEQ96PE7 176 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 USTQ9Y2C2 406 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SCINQ9Y6U3 715 aa16.25■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ENPP3O14638 875 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 B4GALT3O60512 393 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PROSCO94903 275 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PYGMP11217 842 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SKIP12755 728 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PDCLQ13371 301 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 BFSP2Q13515 415 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 LLGL1Q15334 1064 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PKDCCQ504Y2 493 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PMF1Q6P1K2 205 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DNAJC24Q6P3W2 148 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 HASPINQ8TF76 798 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 NR2E1Q9Y466 385 aa16.24■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 GABBR2O75899 941 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 FGGP02679 453 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 BRCC3P46736 316 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 CCL23P55773 120 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TAS2R40P59535 323 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 SYNCQ9H7C4 482 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.23■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 F8VP50 259 aa16.22■□□□□ 0.19
CASQ1-201ENST00000368078 ZMYND10O75800 440 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms