RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMOQ99835 787 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRFN1Q9P244 771 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSFX1Q9UBD0 423 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 DKK4Q9UBT3 224 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF69Q9UC07 566 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANAPC4Q9UJX5 808 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 DUSP10Q9Y6W6 482 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 LEFTY2O00292 366 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIP5K1BO14986 540 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXS1O43638 330 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRP9O43818 475 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFAP3LO75121 409 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 VPS4BO75351 444 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNFRSF6BO95407 300 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRGNP10124 158 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 IDEP14735 1019 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TPH1P17752 444 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CHRM3P20309 590 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF134P52741 427 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARL4CP56559 192 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 LOXL3P58215 753 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 NHLH2Q02577 135 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF844Q08AG5 666 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PKN1Q16512 942 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 INSCQ1MX18 579 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC5A9Q2M3M2 681 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAP1GAP2Q684P5 730 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC70Q6NSX1 233 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CRTC1Q6UUV9 634 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYP26C1Q6V0L0 522 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFX8Q6ZV50 586 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP49Q70CQ1 688 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT73Q86Y46 540 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC28AQ8IWP9 274 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 GALNT15Q8N3T1 639 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 D2HGDHQ8N465 521 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 POC1BQ8TC44 478 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM63Q969Q1 353 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 MIEF2Q96C03 454 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRIG1Q96JA1 1093 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHACTR3Q96KR7 559 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TBATAQ96M53 351 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIB1Q96RU8 372 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PNKPQ96T60 521 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAGR1Q9BTK6 254 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 KATNAL1Q9BW62 490 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTYH3Q9C0H2 523 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHAC1Q9H158 963 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITM2CQ9NQX7 267 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRN3Q9NYV6 651 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 GJD2Q9UKL4 321 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SHOC2Q9UQ13 582 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF114Q9Y508 228 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAD54BQ9Y620 910 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDY1Q9Y6F8 540 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 AQP7P3A6NL99 342 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 E7ENX8 843 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCAM2O15394 837 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR42O15529 346 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASNA1O43681 348 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUN1O94901 812 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLATP00750 562 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNA2P16389 499 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPPBP16860 134 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNA3P22001 575 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 FGFR4P22455 802 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 MST1P26927 711 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC5A2P31639 672 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATICP31939 592 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNR2P34972 360 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-655P-201ENST00000362858 LILRA4P59901 499 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms