RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FGF19O95750 216 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TNNI1P19237 187 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 LHX1P48742 406 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PFKPQ01813 784 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD2Q13200 908 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GRM2Q14416 872 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 STXBP5Q5T5C0 1151 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 LRRTM3Q86VH5 581 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 OSTM1Q86WC4 334 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA18Q8TC71 538 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SHDQ96IW2 340 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GCNAQ96QF7 691 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PHOX2BQ99453 314 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ACBD6Q9BR61 282 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP14Q9HCL3 533 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.22□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.21□□□□□ -1.09
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y858 1186 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 HCRTO43612 131 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KINO60870 393 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KIF20AO95235 890 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GABRR2P28476 465 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PCSK1P29120 753 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 VIPR2P41587 438 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CASP4P49662 377 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 STARD6P59095 220 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PRKCQQ04759 706 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TAF12Q16514 161 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC142Q17RM4 750 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 VITQ6UXI7 678 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GAREM2Q75VX8 874 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PJA1Q8NG27 643 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GIPC2Q8TF65 315 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DNASE1L2Q92874 299 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 MMS19Q96T76 1030 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PKMYT1Q99640 499 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 FOXQ1Q9C009 403 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GPR88Q9GZN0 384 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 BRD9Q9H8M2 597 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ABCB6Q9NP58 842 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NCANO14594 1321 aa8.21□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PDXKO00764 312 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GABRDO14764 452 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 RHOBTB3O94955 611 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CLSTN1O94985 981 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF202O95125 648 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 SMC2O95347 1197 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 NR3C1P04150 777 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC3P17980 439 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CDC25CP30307 473 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 GDI1P31150 447 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2HP62256 183 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TNNC1P63316 161 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4F8P98187 520 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 DPYDQ12882 1025 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 BIRC3Q13489 604 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 TRPC3Q13507 836 aa8.2□□□□□ -1.1
SGMS1-201ENST00000361543 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms