RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM49CP0CI26 452 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCARP24071 287 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR15P49685 360 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 VAMP7P51809 220 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEAD2Q15562 447 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF699Q32M78 642 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM171BQ6P995 826 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SV2AQ7L0J3 742 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB6Q9NP58 842 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH9Q9ULB4 789 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRU2 124 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 IKBKBO14920 756 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFHP08603 1231 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEPH1Q14D04 833 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAREM2Q75VX8 874 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADSSL1Q8N142 457 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR152Q8TDT2 470 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIPC2Q8TF65 315 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYLPFQ96A32 169 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECI2O75521 394 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM163BP0C2L3 166 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2F1P24903 491 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 VCPP55072 806 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2HP62256 183 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPEPQ07075 957 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP3CAQ08209 521 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF667Q5HYK9 610 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 STKLD1Q8NE28 680 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB16Q96NS5 453 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX25Q9H3E2 840 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL21Q9HBE4 155 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLSTN1O94985 981 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDGFRBP09619 1106 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT13P13646 458 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRR2P28476 465 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3CAP42336 1068 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP1GAPP47736 663 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCLMP48507 274 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISM2Q6H9L7 571 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIX5Q8N196 739 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSG101Q99816 390 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNT16Q9UBV4 365 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCANO14594 1321 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRBA1A5PL33 1030 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CETN3O15182 167 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF19O95750 216 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DRAP01903 254 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 BMP6P22004 513 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC5P78333 572 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDR2Q16832 855 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD40Q6AI12 368 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCD2Q92925 531 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCED1BQ96HM7 432 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDCBP2Q9H190 292 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA14Q9ULX7 337 aa20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms