RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 CWH43Q9H720 699 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 MARCH5Q9NX47 278 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 TSPAN16Q9UKR8 245 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 CDH9Q9ULB4 789 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 NCANO14594 1321 aa20.9■□□□□ 0.94
CCDC71-201ENST00000321895 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 M0QYV0 167 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SYN3O14994 580 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 EPHB4P54760 987 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 OVOS1Q6IE37 1185 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SYT15Q9BQS2 421 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CARNS1A5YM72 827 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MYBL1P10243 752 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TNNT1P13805 278 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GPC5P78333 572 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MON1BQ7L1V2 547 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 RFFLQ8WZ73 363 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ACBD6Q9BR61 282 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 VWA8A3KMH1 1905 aa20.88■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GNG11P61952 73 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 THEM5Q8N1Q8 247 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 HERVK_113Q902F9 699 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 DPF3Q92784 378 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 NOX5Q96PH1 765 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 YME1L1Q96TA2 773 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 HESX1Q9UBX0 185 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MYH10P35580 1976 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MMP8P22894 467 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TCEAL1Q15170 157 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 FUT10Q6P4F1 479 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 RHOT2Q8IXI1 618 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF653Q96CK0 615 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.87■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 FAM170AA1A519 330 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ATP2C2O75185 946 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CAPN15O75808 1086 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 OAZ2O95190 189 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GJB5O95377 273 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CYP1A2P05177 515 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SETSIPP0DME0 302 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC130P13994 396 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GPD2P43304 727 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PKDCCQ504Y2 493 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 LIN9Q5TKA1 542 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 CALB1P05937 261 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 LAG3P18627 525 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PBX3P40426 434 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 BCAT1P54687 386 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PTP4A2Q12974 167 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TTC30AQ86WT1 665 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ERICH1Q86X53 443 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.85■□□□□ 0.93
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM58Q8NG06 486 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms