RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 FAM83AQ86UY5 434 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 NSL1Q96IY1 281 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 PAFAH2Q99487 392 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 VCXQ9H320 206 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.55□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 IFNB1P01574 187 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 IL1BP01584 269 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 KRT7P08729 469 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 GLRA2P23416 452 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 GPX6P59796 221 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 KLC1Q07866 573 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CHSY1Q86X52 802 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 PALM2Q8IXS6 379 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 BANPQ8N9N5 519 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 E7ESA3 106 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SPAG6O75602 509 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MT-ND3P03897 115 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 SKIP12755 728 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ETS1P14921 441 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZNF132P52740 706 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ARFIP2P53365 341 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZBTB16Q05516 673 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 KRT72Q14CN4 511 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MAPK6Q16659 721 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 IRGCQ6NXR0 463 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 PDIK1LQ8N165 341 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CDHR1Q96JP9 859 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MCEEQ96PE7 176 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CYTH2Q99418 400 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.54□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CLUHO75153 1309 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 STBD1O95210 358 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CFHP08603 1231 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 GM2AP17900 193 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ADRA1DP25100 572 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TFDP1Q14186 410 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ANO7Q6IWH7 933 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 STMN2Q93045 179 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 GYG2O15488 501 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ZNF862O60290 1169 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 NPTXRO95502 500 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ATP4AP20648 1035 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 ACOT2P49753 483 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 CDK16Q00536 496 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 NCOA4Q13772 614 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 XKR3Q5GH77 459 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 BBS12Q6ZW61 710 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.53□□□□□ -0.08
MKS1-201ENST00000313863 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms