RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 TEX28O15482 410 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 ADH1AP07327 375 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CNPP09543 421 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 P4HA1P13674 534 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 NRIP1P48552 1158 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 NDUFV1P49821 464 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CTXN3Q4LDR2 81 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 WDR44Q5JSH3 913 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SPOPLQ6IQ16 392 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 KIAA1328Q86T90 577 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 ADGRF2Q8IZF7 708 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM86AQ8N2M4 240 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 BAP1Q92560 729 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 TLE6Q9H808 572 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 POLIQ9UNA4 740 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.73□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 LRRN2O75325 713 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 OAZ2O95190 189 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 LCA5LO95447 670 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 KLRC2P26717 231 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 DUSP6Q16828 381 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 RRAGAQ7L523 313 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 DPH6Q7L8W6 267 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 UBXN4Q92575 508 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 KLHL5Q96PQ7 755 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 NIF3L1Q9GZT8 377 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 GCNT4Q9P109 453 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CDY1Q9Y6F8 540 aa12.72□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 ASPAP45381 313 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 HYAL1Q12794 435 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC122Q5T0U0 273 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SLC35F6Q8N357 371 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA18Q8TC71 538 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CARD6Q9BX69 1037 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 IGFLR1Q9H665 355 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 CDC23Q9UJX2 597 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.71□□□□□ -0.37
C16orf46-201ENST00000299578 A0A0U1RQJ8 604 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OR6C75A6NL08 312 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC53A6NM62 1247 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 EPHB6O15197 1021 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ADAM12O43184 909 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TBC1D4O60343 1298 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TACC1O75410 805 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 OR1D2P34982 312 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 RAP1GAPP47736 663 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LHX1P48742 406 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CLCN4P51793 760 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 VAV2P52735 878 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 KIF5AQ12840 1032 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GBP6Q6ZN66 633 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CEP112Q8N8E3 955 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 PPM1EQ8WY54 764 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 BCO2Q9BYV7 579 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 SNX25Q9H3E2 840 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 DEF6Q9H4E7 631 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 MYO6Q9UM54 1294 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 COL6A3P12111 3177 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 MYH10P35580 1976 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GABRDO14764 452 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 TADA3O75528 432 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 NOL4O94818 638 aa12.7□□□□□ -0.38
C16orf46-201ENST00000299578 GLUD1P00367 558 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms