RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SPTLC1O15269 473 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 DAPK3O43293 454 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PDCLQ13371 301 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ACOT1Q86TX2 421 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 XYLT1Q86Y38 959 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SRRDQ9UH36 339 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FSCN2O14926 492 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KRT3P12035 628 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA3P32297 505 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TAP1Q03518 808 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 MGAT3Q09327 533 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP42Q96MM3 310 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 HCRTO43612 131 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CUL1Q13616 776 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 DPH5Q9H2P9 285 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PTGESO14684 152 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 THPOP40225 353 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PTGISQ16647 500 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CYP1B1Q16678 543 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SEC14L1Q92503 715 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FAM49BQ9NUQ9 324 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA7A9QM74 516 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PFKMP08237 780 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PTGIRP43119 386 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 JAMLQ86YT9 394 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 DPEP3Q9H4B8 488 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3R2O00459 728 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GABRB2P47870 512 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GPS2Q13227 327 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PCYOX1Q9UHG3 505 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 RALAP11233 206 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FGFR1P11362 822 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 NNTQ13423 1086 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 RPAINQ86UA6 219 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 EMC1Q8N766 993 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF560Q96MR9 790 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 RAB17Q9H0T7 212 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 FAM187AA6NFU0 413 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 A8MXQ7 604 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ1P48048 391 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TAF6P49848 677 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 ERP44Q9BS26 406 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PSMA2P25787 234 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PNPLA4P41247 253 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 TTC30AQ86WT1 665 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM4-201ENST00000298454 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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