RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 SH3GL2Q99962 352 aa17.13■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.13■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ROBO3Q96MS0 1386 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 RASSF10A6NK89 507 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 E2F6O75461 281 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PPIL6Q8IXY8 311 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 LRRC71Q8N4P6 559 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PRELID2Q8N945 189 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 WDR18Q9BV38 432 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM15Q9C019 465 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 FAM198AQ9UFP1 575 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PNMA3Q9UL41 463 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PYGBP11216 843 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 KCNT1Q5JUK3 1230 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 BATF3Q9NR55 127 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 CHST7Q9NS84 486 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MAPTP10636 758 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 GHRP10912 638 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PRAMEP78395 509 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 EXD1Q8NHP7 514 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PGBD4Q96DM1 585 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 FAM53CQ9NYF3 392 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.12■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SNHG28P0DPA3 235 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 FLT3P36888 993 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 20.3
MEGF6-201ENST00000294599 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 FUKQ8N0W3 1084 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ALG3Q92685 438 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB18Q99592 522 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 HSD17B14Q9BPX1 270 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 DCLK3Q9C098 648 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 HAO1Q9UJM8 370 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 H3BRJ5 948 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 STX3Q13277 289 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM121Q9BTD3 319 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 USP20Q9Y2K6 914 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ANP32DO95626 131 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MCF2P10911 925 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 INPP1P49441 399 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 KLC1Q07866 573 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 DACT2Q5SW24 774 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 CNPY4Q8N129 248 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 NCLNQ969V3 563 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 LRFN2Q9ULH4 789 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MAGEB5Q9BZ81 275 aa17.11■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 BMT2Q1RMZ1 405 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 DUPD1Q68J44 220 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MICALL2Q8IY33 904 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SNX9Q9Y5X1 595 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 NCANO14594 1321 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TM4SF1P30408 202 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MTBPQ96DY7 904 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MTMR12Q9C0I1 747 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 RSAD1Q9HA92 442 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 O00370 1275 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 RFC5P40937 340 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SERPINB4P48594 390 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 NLRP9Q7RTR0 991 aa17.1■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ERMARDQ5T6L9 678 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 THTPAQ9BU02 230 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PCMTD2Q9NV79 361 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 NINJ2Q9NZG7 142 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SNX2O60749 519 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 LCP1P13796 627 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SPDYCQ5MJ68 293 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 B2RBV5 119 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 ATP6V1G2O95670 118 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 CERKQ8TCT0 537 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.09■□□□□ 0.33
MEGF6-201ENST00000294599 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms