RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 SOAT2O75908 522 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 P4HA1P13674 534 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ATF6P18850 670 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GABRR2P28476 465 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 WEE1P30291 646 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 STARD6P59095 220 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 FAM171BQ6P995 826 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 OSTM1Q86WC4 334 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 DNASE1L2Q92874 299 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 PKMYT1Q99640 499 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 SYT15Q9BQS2 421 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.26■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GJA1P17302 382 aa20.25■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 FCARP24071 287 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 NR2F2P24468 414 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 MAGEA11P43364 429 aa20.25■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 VSTM1Q6UX27 236 aa20.25■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 PRSS33Q8NF86 280 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GIPC2Q8TF65 315 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TAF4BQ92750 862 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 IRF7Q92985 503 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 NELL2Q99435 816 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TASP1Q9H6P5 420 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 MYBPHLA2RUH7 354 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 KRT13P13646 458 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 CASP4P49662 377 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 MYL6P60660 151 aa20.24■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 BRD9Q9H8M2 597 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 OBP2AQ9NY56 170 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 EHD2Q9NZN4 543 aa20.24■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.24■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 DPYSL4O14531 572 aa20.23■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF263O14978 683 aa20.23■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 CYP2F1P24903 491 aa20.23■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 LMO2P25791 158 aa20.23■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 ZNF699Q32M78 642 aa20.23■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 SMARCE1Q969G3 411 aa20.23■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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MALSU1-201ENST00000287543 CLSTN1O94985 981 aa20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 PDGFRBP09619 1106 aa20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 TCF15Q12870 199 aa20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 VITQ6UXI7 678 aa20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.22■□□□□ 0.83
MALSU1-201ENST00000287543 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.22■□□□□ 0.83
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