RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ANXA9O76027 345 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 WEE2P0C1S8 567 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CASP1P29466 404 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 GALCP54803 685 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 HIC2Q96JB3 615 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SPON2Q9BUD6 331 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RAD51CO43502 376 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 AGR3Q8TD06 166 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PIGBQ92521 554 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 FKBP9O95302 570 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 EMC2Q15006 297 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MICU2Q8IYU8 434 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RDM1Q8NG50 284 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM260Q9NX78 707 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TM9SF1O15321 606 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MLNP12872 115 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PSMC3P17980 439 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 GPD1P21695 349 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 LTKP29376 864 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TIMM44O43615 452 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 KIZQ2M2Z5 673 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 NAT9Q9BTE0 207 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 OSBPL10Q9BXB5 764 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CAND2O75155 1236 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PPP3CCP48454 512 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CNTN1Q12860 1018 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MAGED4Q96JG8 741 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PNPLA4P41247 253 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SNAP25P60880 206 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RCN1Q15293 331 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SIK2Q9H0K1 926 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 POLIQ9UNA4 740 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TRIM24O15164 1050 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CNGA2Q16280 664 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 BBS2Q9BXC9 721 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 NMT2O60551 498 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 THRAP10827 490 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 P3H2Q8IVL5 708 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 FANCEQ9HB96 536 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF185O15231 689 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PDGFRAP16234 1089 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ARHGEF7Q14155 803 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 XKR3Q5GH77 459 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 IRAK1P51617 712 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 PDK2Q15119 407 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF544Q6NX49 715 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF609O15014 1411 aa8.29□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ENO4A6NNW6 628 aa8.28□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 ATP9BO43861 1147 aa8.28□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 TGM2P21980 687 aa8.28□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 YAF2Q8IY57 180 aa8.28□□□□□ -1.08
LIMD1-201ENST00000273317 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms