RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM132AQ24JP5 1023 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF720Q7Z2F6 126 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2W6PQ8NHA6 318 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-201ENST00000246533 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC40A1Q9NP59 571 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC27A1Q6PCB7 646 aa27.9■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP6Q96FZ7 201 aa27.9■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 ERP44Q9BS26 406 aa27.9■■■□□ 2.06
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CAPNS1-201ENST00000246533 FLT3P36888 993 aa27.88■■■□□ 2.05
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEZ6Q53EL9 994 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOT2Q8IXI1 618 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 SEL1LQ9UBV2 794 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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