RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 PRAMEF12O95522 483 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FGF19O95750 216 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 F11P03951 625 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KRT19P08727 400 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TMEM191BP0C7N4 346 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CYP24A1Q07973 514 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SURF1Q15526 300 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FAM171BQ6P995 826 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 WDR49Q8IV35 697 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NELFCDQ8IXH7 590 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 C12orf56Q8IXR9 622 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FAM200AQ8TCP9 573 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ZNF516Q92618 1163 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PAGE5Q96GU1 130 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 BCO2Q9BYV7 579 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ABCB6Q9NP58 842 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SLC39A2Q9NP94 309 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 OBP2AQ9NY56 170 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CFAP54Q96N23 3096 aa16■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MYBPHLA2RUH7 354 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CHADO15335 359 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ATP2C2O75185 946 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SLFN14P0C7P3 912 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CYP2F1P24903 491 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 LMO2P25791 158 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MAGEA9P43362 315 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NLRP12P59046 1061 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TSPY1Q01534 308 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PSMD6Q15008 389 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 DPH6Q7L8W6 267 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 RDH13Q8NBN7 331 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NELL1Q92832 810 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 HPDLQ96IR7 371 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 HPSEQ9Y251 543 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FAM186AA6NE01 2351 aa15.99■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MAN2B1O00754 1011 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TADA3O75528 432 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CDC25CP30307 473 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 LHX1P48742 406 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CYP2J2P51589 502 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MYL7Q01449 175 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 STK4Q13043 487 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 VEPH1Q14D04 833 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FAM3CQ92520 227 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CGRRF1Q99675 332 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FBXO4Q9UKT5 387 aa15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 A0A1B0GVL5 298 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NOL4O94818 638 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TNNC2P02585 160 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CHRNB1P11230 501 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TDGF1P13385 188 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PFKFB1P16118 471 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CMA1P23946 247 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SOX9P48436 509 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MYO1EQ12965 1108 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MTAPQ13126 283 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 GAS6Q14393 721 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 DDR2Q16832 855 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CFAP221Q4G0U5 840 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ADSSL1Q8N142 457 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 RIN3Q8TB24 985 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MYRFLQ96LU7 910 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms