RNA–Protein interactions for RNA: YJL208C

NUC1, Transcript of Major mitochondrial nuclease, yeast

Gene NUC1, Length 990 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUC1	YJL208C	YNL194C	P40169	301 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YIL024C	P40543	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		7.27	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	POP5	P28005	173 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	ICS2	P38284	255 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PET100	P38958	111 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	TAX4	P47030	604 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	VPS55	P47111	140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	HST4	P53688	370 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YNR071C	P53757	342 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	HOR7	Q05827	59 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RXT3	Q07458	294 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.25	□□□□□ -1.25	not detected
NUC1	YJL208C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YPS1	P32329	569 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PRY2	P36110	329 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	SFT2	P38166	215 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	MIC12	P38341	106 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RTS2	P40962	232 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	CPD1	P53314	239 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PCC1	Q3E833	88 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	POR2	P40478	281 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	TIM18	Q08749	192 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	COX2	P00410	251 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	CNB1	P25296	175 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	HMX1	P32339	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	AFR1	P33304	620 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YCR041W	P37265	110 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PHS1	P40857	217 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	ATG27	P46989	271 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	CAB4	P53332	305 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	DUG3	P53871	357 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	MRX11	Q03079	207 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	CYC3	P06182	269 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	CYB5	P40312	120 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	TOS8	P53147	276 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	OCA2	P53949	197 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	YMR253C	Q04835	414 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	LDS2	Q08218	356 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	IRC23	Q08416	157 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	PRM3	Q08931	133 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NUC1	YJL208C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MRPL4	P36517	319 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	IMP2	P46972	177 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	DSK2	P48510	373 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YML122C	Q03207	126 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	LOA1	Q06508	300 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	TRS20	P38334	175 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YPI1	P43587	155 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YDL186W	P48568	277 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	NCE103	P53615	221 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	ATX2	Q12067	313 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	AYT1	Q12226	474 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	ERV2	Q12284	196 aa		7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YHR213W	P0CI67	198 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	ERS1	P17261	260 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	LAC1	P28496	418 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MRPS9	P38120	278 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YHR173C	P38864	112 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	TIM21	P53220	239 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MSA1	Q08471	629 aa		7.19	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	MRS1	P07266	363 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	DDI2	P0CH63	225 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	DDI3	P0CH64	225 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YKL102C	P34249	101 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	HHO1	P53551	258 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	UBC7	Q02159	165 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	FIT2	Q08906	153 aa		7.18	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YFL068W	P0CX99	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	PGD1	P40356	397 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	GPI2	P46961	280 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	SNO1	Q03144	224 aa		7.17	□□□□□ -1.26
NUC1	YJL208C	YML108W	Q03759	105 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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