RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeastyeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHK8YHR048W YNL194CP40169 301 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YGR018CP53211 109 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YGR219WP53307 113 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU10Q03050 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W AVO2Q04749 426 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU20Q08322 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PRM3Q08931 133 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PAU9Q3E770 120 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W VMA9Q3E7B6 73 aa5.21□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W URA2P07259 2214 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YNK1P36010 153 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MIC12P38341 106 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W FLO5P38894 1075 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PET100P38958 111 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W POG1P40473 351 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W POR2P40478 281 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TAX4P47030 604 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TOS8P53147 276 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ERV25P54837 211 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RXT3Q07458 294 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YOR352WQ08816 343 aa5.2□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YMR316C-AI2HB70 103 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W COX2P00410 251 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W POP5P28005 173 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YKL102CP34249 101 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YCR041WP37265 110 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W SFT2P38166 215 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YPI1P43587 155 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W NCE103P53615 221 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W HST4P53688 370 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YGR035W-AQ45U48 73 aa5.19□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W CYC3P06182 269 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W HMX1P32339 317 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ICS2P38284 255 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ATG27P46989 271 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W LDS2Q08218 356 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MSA1Q08471 629 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TIM18Q08749 192 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YER190C-BP0CX94 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YEL077W-AP0CX95 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YGR296C-BP0CX96 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YPL283W-BP0CX97 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YPR204C-AP0CX98 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YFL068WP0CX99 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YLL066W-AP0CY00 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YLL067W-AP0CY01 160 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ERS1P17261 260 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RPS2P25443 254 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W UBC7Q02159 165 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MRX11Q03079 207 aa5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TDH1P00360 332 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MRPL4P36517 319 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W IMD2P38697 523 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W CYB5P40312 120 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W WWM1P43582 211 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W LOC1P43586 204 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RRG8Q06109 277 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W LOA1Q06508 300 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W IRC23Q08416 157 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PCC1Q3E833 88 aa5.17□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W AFR1P33304 620 aa5.16□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TIR2P33890 251 aa5.16□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W SNF11P38956 169 aa5.16□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YIL024CP40543 189 aa5.16□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W AYT1Q12226 474 aa5.16□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W DDI2P0CH63 225 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W DDI3P0CH64 225 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YHR213WP0CI67 198 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MSN1P22148 382 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W TRS20P38334 175 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YHR173CP38864 112 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W PHS1P40857 217 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W DSK2P48510 373 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W OCA2P53949 197 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W YML122CQ03207 126 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W ZEO1Q08245 113 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W Q0142Q9ZZW4 58 aa5.15□□□□□ -1.58
YHK8YHR048W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W RPA43P46669 326 aa5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YMR253CQ04835 414 aa5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W FIT2Q08906 153 aa5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W ATX2Q12067 313 aa5.14□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W ADH3P07246 375 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MRS1P07266 363 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MRP2P10663 115 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W LAC1P28496 418 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W NNK1P36003 928 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W CMC1P36064 111 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MRPS9P38120 278 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W HSP10P38910 106 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W PGD1P40356 397 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YIL077CP40508 320 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms