RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 TBATAQ96M53 351 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 NEURL2Q9BR09 285 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 VPS11Q9H270 941 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 Q9H521 79 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 UCK1Q9HA47 277 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 POLE3Q9NRF9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 NUP50Q9UKX7 468 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PADI4Q9UM07 663 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 AK5Q9Y6K8 562 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GLI3P10071 1580 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ATP7BP35670 1465 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 EP400Q96L91 3159 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1W2PQ27 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1W2PQ64 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1W2PQD8 194 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LACTBL1A8MY62 500 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 H3BRJ5 948 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TBX3O15119 743 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 HDAC3O15379 428 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RHOBTB3O94955 611 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 UNC5CO95185 931 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 EYA4O95677 639 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RETP07949 1114 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GFAPP14136 432 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GRK2P25098 689 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GJA5P36382 358 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 CAP2P40123 477 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC26A3P40879 764 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PRCPP42785 496 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ASPHQ12797 758 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RALGDSQ12967 914 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ACVR2BQ13705 512 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GRM2Q14416 872 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TOMM20Q15388 145 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 IGSF11Q5DX21 431 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SHEQ5VZ18 495 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RNF43Q68DV7 783 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TTLQ8NG68 377 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 UCMAQ8WVF2 138 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKS1AQ92625 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ACAP3Q96P50 834 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 MED15Q96RN5 788 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 YME1L1Q96TA2 773 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 GON7Q9BXV9 100 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 DPH5Q9H2P9 285 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 OR51B5Q9H339 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LGR6Q9HBX8 967 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SH3GLB2Q9NR46 395 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 FNIP2Q9P278 1114 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SEPT3Q9UH03 358 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SNX7Q9UNH6 387 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.5□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SAMMSON-210ENST00000641260 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms