RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, human

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREBBP-215	ENST00000635899	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MCM6	Q14566	821 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CCDC6	Q16204	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	TAF12	Q16514	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SV2C	Q496J9	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	KIF2C	Q99661	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899		A0A0B4J269	797 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CYB561D2	O14569	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC30A4	O14863	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	HR	O43593	1189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	EXTL3	O43909	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	RNF40	O75150	1001 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	TADA3	O75528	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ITGB3	P05106	788 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CYP11A1	P05108	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CNR2	P34972	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	UBA7	P41226	1012 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	GPR15	P49685	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF131	P52739	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	LILRA4	P59901	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	TSPY1	Q01534	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	GRIN1	Q05586	938 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	USP4	Q13107	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	RABEP1	Q15276	862 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CSRP2	Q16527	193 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CD302	Q8IX05	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	RAD54L	Q92698	747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	AK8	Q96MA6	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CREBBP-215	ENST00000635899	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms