RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619644.4

SMTN-223, Transcript of smoothelin, human

TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-223	ENST00000619644	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MON1B	Q7L1V2	547 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644		A0A1W2PPM1	405 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	LYPLA2	O95372	231 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GTF2H1	P32780	548 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	IRF6	O14896	467 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	EXTL3	O43909	919 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ENTPD5	O75356	428 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CCND2	P30279	289 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ALDH3A1	P30838	453 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RFC5	P40937	340 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	OSTN	P61366	133 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NOMO3	P69849	1222 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	OVGP1	Q12889	678 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SPARCL1	Q14515	664 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MUM1	Q2TAK8	710 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLCO2A1	Q92959	643 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	FBXO40	Q9UH90	709 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ATP2A1	O14983	1001 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DGAT1	O75907	488 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TJP3	O95049	919 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PSAP	P07602	524 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CD19	P15391	556 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	INPP5D	Q92835	1189 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PARVA	Q9NVD7	372 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ZACN	Q401N2	412 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	RNF220	Q5VTB9	566 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NPHS2	Q9NP85	383 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	CBX6	O95503	412 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	WEE2	P0C1S8	567 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SSTR1	P30872	391 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GAD2	Q05329	585 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03	7e-8	■■■■■ 44.2
SMTN-223	ENST00000619644	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	EXD1	Q8NHP7	514 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	UCMA	Q8WVF2	138 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	WNT10B	O00744	389 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	PMM2	O15305	246 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	VNN1	O95497	513 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	KRT4	P19013	534 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SESN3	P58005	492 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ACTR2	P61160	394 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	NCOA4	Q13772	614 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	AKT1S1	Q96B36	256 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	FBXL18	Q96ME1	805 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	LIAS	O43766	372 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	T-ENOL	P0DO92	83 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	GART	P22102	1010 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	ORC1	Q13415	861 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	EMC2	Q15006	297 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SMTN-223	ENST00000619644	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		15.22	■□□□□ 0.03

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