RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGEB18	Q96M61	343 aa		11.9	□□□□□ -0.5
AKAP9-216	ENST00000619023	GAK	O14976	1311 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PTEN	P60484	403 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CPB2	Q96IY4	423 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	OGT	O15294	1046 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023		E5RI56	91 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EML1	O00423	815 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CYP3A4	P08684	503 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NOTUM	Q6P988	496 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TATDN2	Q93075	761 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EVX2	Q03828	476 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		11.89	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PYGB	P11216	843 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CPB1	P15086	417 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MTM1	Q13496	603 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PDK1	Q15118	436 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT35	Q92764	455 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PROSC	O94903	275 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ITGA4	P13612	1032 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RARG	P13631	454 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SCFD2	Q8WU76	684 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB22	O15209	634 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RRM1	P23921	792 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM153B	P0C7A2	387 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT4	P19013	534 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM153C	Q494X1	144 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023		F8W8V4	182 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB39	O15060	712 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RBP3	P10745	1247 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	MYL2	P10916	166 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	HADHA	P40939	763 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	RHBDL3	P58872	404 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF235	Q14590	738 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CHI3L2	Q15782	390 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	POLB	P06746	335 aa		11.87	□□□□□ -0.51
AKAP9-216	ENST00000619023	CTSH	P09668	335 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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