RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-222	ENST00000597718	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	NCAM2	O15394	837 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ITGB3	P05106	788 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	MTAP	Q13126	283 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GPR158	Q5T848	1215 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ITIH5	Q86UX2	942 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	STKLD1	Q8NE28	680 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GPT2	Q8TD30	523 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FAM3C	Q92520	227 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	HPS3	Q969F9	1004 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF560	Q96MR9	790 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ARNTL	O00327	626 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	MAN2B1	O00754	1011 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	YEATS4	O95619	227 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SOX9	P48436	509 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	BFSP1	Q12934	665 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ALCAM	Q13740	583 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	VEPH1	Q14D04	833 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TTC8	Q8TAM2	541 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	L1RE1	Q9UN81	338 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		15.18	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	EXTL3	O43909	919 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PRAMEF12	O95522	483 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	KRT19	P08727	400 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GART	P22102	1010 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CCNE1	P24864	410 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PNPLA4	P41247	253 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	GPR15	P49685	360 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TAF12	Q16514	161 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	DCLK2	Q8N568	766 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	E2F7	Q96AV8	911 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	IL21	Q9HBE4	155 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		15.17	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	DPYSL4	O14531	572 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SPTLC2	O15270	562 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CHAD	O15335	359 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	HUS1	O60921	280 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	FGF19	O95750	216 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	TSPY1	Q01534	308 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	E2F4	Q16254	413 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CCDC142	Q17RM4	750 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		15.16	■□□□□ 0.02
FCHO1-222	ENST00000597718	CXorf38	Q8TB03	319 aa		15.16	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms