RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARPP19P56211 112 aa20.88■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 ACOT1Q86TX2 421 aa20.86■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 KLRC2P26717 231 aa20.85■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 GUCD1Q96NT3 240 aa20.85■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.85■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.85■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 WDR27A2RRH5 827 aa20.84■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TTC39CQ8N584 583 aa20.84■□□□□ 0.93
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SMC5-AS1-201ENST00000594708 SHC3Q92529 594 aa20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PKMYT1Q99640 499 aa20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CALCAP01258 141 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RFX1P22670 979 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP8P40818 1118 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAB33AQ14088 237 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.83■□□□□ 0.93
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.83■□□□□ 0.93
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