RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CITO14578 2027 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 C2CD2LO14523 706 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC30A4O14863 429 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX28O15482 410 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 B4GALT3O60512 393 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 URODP06132 367 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TPM2P07951 284 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GTF2H1P32780 548 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKCQQ04759 706 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 NETO1Q8TDF5 533 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ARL5CA6NH57 179 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM170BA6NMN3 283 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 LACTBL1A8MY62 500 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 C1RP00736 705 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SOD2P04179 222 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MLH1P40692 756 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 UBXN2BQ14CS0 331 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM212AQ96EL1 285 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GAD1Q99259 594 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP3A5P20815 502 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIK3Q13003 919 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MAN2A1Q16706 1144 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF214Q8ND24 703 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC127Q96BQ5 260 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 DDHD2O94830 711 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNI1P19237 187 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35C1Q96A29 364 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 KLK14Q9P0G3 267 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-214ENST00000592483 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 THP07101 528 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DLATP10515 647 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DMWDQ09019 674 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB6Q15916 424 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 JADE1Q6IE81 842 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 BEST2Q8NFU1 509 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FGF14Q92915 247 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN23Q96B33 292 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF12Q96FN5 646 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP42Q96MM3 310 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 RBSNQ9H1K0 784 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS13Q9NVM9 706 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ANK1P16157 1881 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PTGESO14684 152 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 NRP1O14786 923 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PMM2O15305 246 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 P4HA2O15460 535 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TNNC2P02585 160 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31D3P0C874 917 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT31Q15323 416 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 UVSSAQ2YD98 709 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 PARM1Q6UWI2 310 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 TAS1R1Q7RTX1 841 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 LTB4R2Q9NPC1 389 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-214ENST00000592483 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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