RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	LPIN2	Q92539	896 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.38	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	AP1G1	O43747	822 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	OFD1	O75665	1012 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	DNAJB5	O75953	348 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CHEK2	O96017	543 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GNAI3	P08754	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	HDC	P19113	662 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GNAI1	P63096	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	FPGS	Q05932	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PIGF	Q07326	219 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	LRRC41	Q15345	812 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.37	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084		A0A088AWK7	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	KIF20A	O95235	890 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	FOLR3	P41439	243 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PTH2R	P49190	550 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	RARRES1	P49788	294 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	USP37	Q86T82	979 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SMO	Q99835	787 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.36	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084		H3BML4	177 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084		H3BUI4	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	TOR1B	O14657	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	YY2	O15391	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	PPP3CB	P16298	524 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	CXCR5	P32302	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	IL12RB1	P42701	662 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	NPTX2	P47972	431 aa		4.35	□□□□□ -1.71
COX11-208	ENST00000576084	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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