RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 C8AP07357 584 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDGFRBP09619 1106 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELF1P32519 619 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACBD6Q9BR61 282 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNX25Q9H3E2 840 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 NME7Q9Y5B8 376 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRRG1O14668 218 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMYND10O75800 440 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 P4HA1P13674 534 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASPAP45381 313 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPY1Q01534 308 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2C2O75185 946 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCSK1P29120 753 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC142Q17RM4 750 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR11A4FU01 709 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM163BP0C2L3 166 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ITIH3Q06033 890 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP4Q13115 394 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR44Q5JSH3 913 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CES5AQ6NT32 575 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCEAL8Q8IYN2 117 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TATDN2Q93075 761 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNJ18B7U540 433 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PMM2O15305 246 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL9P15248 144 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYL5Q02045 173 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRMPQ12912 555 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNJ12Q14500 433 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 UVSSAQ2YD98 709 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 PKMYT1Q99640 499 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYT15Q9BQS2 421 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCO2Q9BYV7 579 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCLQ9NW38 375 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 A8MXQ7 604 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL16O15467 120 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP1P13497 986 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR149Q86SP6 731 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH9Q9ULB4 789 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAFFQ9ULX9 164 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 P4HA2O15460 535 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CETN1Q12798 172 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMO3Q8TAP4 145 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUSD6Q92537 303 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0C4DFX4 3053 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOAT2O75908 522 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD58P19256 250 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAN2A1Q16706 1144 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM171BQ6P995 826 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARID3AQ99856 593 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms