RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIB1	Q96RU8	372 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ETAA1	Q9NY74	926 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		E9PLN8	166 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GPANK1	O95872	356 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FCER1A	P12319	257 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HOXA5	P20719	270 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC6A2	P23975	617 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	IL1R2	P27930	398 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SERPINB3	P29508	390 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TEC	P42680	631 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	UCP3	P55916	312 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC15A4	Q8N697	577 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CEP83	Q9Y592	693 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	RAD54B	Q9Y620	910 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MARCH11	A6NNE9	402 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		M0QYG6	137 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KCNQ3	O43525	872 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PLA2G6	O60733	806 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PRAMEF10	O60809	474 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TCEA3	O75764	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TYRP1	P17643	537 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ITGAL	P20701	1170 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PPM1A	P35813	382 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SCNN1G	P51170	649 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	COPA	P53621	1224 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	BLOC1S1	P78537	153 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	STK3	Q13188	491 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC29A2	Q14542	456 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	LAYN	Q6UX15	382 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CHST8	Q9H2A9	424 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MUSK	O15146	869 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIAP1	O43715	76 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PHKA1	P46020	1223 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PTTG1IP	P53801	180 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	POLE2	P56282	527 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	DYRK1A	Q13627	763 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ARHGEF7	Q14155	803 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	ICAM4	Q14773	271 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830		Q6ZRM9	215 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	STK33	Q9BYT3	514 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	KLC2	Q9H0B6	622 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	VPS11	Q9H270	941 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	CA14	Q9ULX7	337 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SNAP23-208	ENST00000563830	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44

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