RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559551.5

RABGGTA-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 2,060 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-209ENST00000559551 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGGTA-209ENST00000559551 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
RABGGTA-209ENST00000559551 PTPRDP23468 1912 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 I3L4J1 428 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CD19P15391 556 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GLB1LQ6UWU2 654 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MON1BQ7L1V2 547 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SENP8Q96LD8 212 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CASD1Q96PB1 797 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DNAJB4Q9UDY4 337 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 O00370 1275 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA0355O15063 1070 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 BRCC3P46736 316 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA0319Q5VV43 1072 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 WSCD1Q658N2 575 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ACOT1Q86TX2 421 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 COLGALT2Q8IYK4 626 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HASPINQ8TF76 798 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TJP2Q9UDY2 1190 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CYB561D2O14569 222 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ENC1O14682 589 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GABRDO14764 452 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF4AO95239 1232 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TUBB4AP04350 444 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 APPL2Q8NEU8 664 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 OR6B3Q8NGW1 331 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KIF18AQ8NI77 898 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RFFLQ8WZ73 363 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MICAL2O94851 1124 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TIMP1P01033 207 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PFKMP08237 780 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PDGFRBP09619 1106 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 VDRP11473 427 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CSF2RAP15509 400 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ATP2C2O75185 946 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PALMO75781 387 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CYP1A2P05177 515 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CASQ1P31415 396 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 AMPD2Q01433 879 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TCEAL1Q15170 157 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PKDCCQ504Y2 493 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 DPH6Q7L8W6 267 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 UNC93AQ86WB7 457 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 A8MXQ7 604 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NCK2O43639 380 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 HUS1O60921 280 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 B3GAT3O94766 335 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 RRM1P23921 792 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GPD2P43304 727 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 GPC5P78333 572 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CNGA2Q16280 664 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 SGO2Q562F6 1265 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TTC30AQ86WT1 665 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 TTC39CQ8N584 583 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 ZNF653Q96CK0 615 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NOX5Q96PH1 765 aa15.17■□□□□ 0.02
RABGGTA-209ENST00000559551 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms