RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	INSIG1	O15503	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	NDUFS2	O75306	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	DNAJB5	O75953	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CHRM3	P20309	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CD6	P30203	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CLUL1	Q15846	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843		H3BNC9	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843		K7ESF4	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SOAT2	O75908	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PDHA1	P08559	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CPE	P16870	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ITGAL	P20701	1170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PLCD1	P51178	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SLC16A1	P53985	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	RABEP1	Q15276	862 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	IPP	Q9Y573	584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	QSOX1	O00391	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ONECUT2	O95948	504 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	HSD3B2	P26439	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CNGA1	P29973	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	KAT5	Q92993	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	F2RL2	O00254	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PPM1D	O15297	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	VPS4B	O75351	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CHEK2	O96017	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GJB1	P08034	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	C5AR1	P21730	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	EDNRB	P24530	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	JADE3	Q92613	823 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GNAI3	P08754	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MAL	P21145	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CYP2C18	P33260	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MASP1	P48740	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CLCN2	P51788	898 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	GNAI1	P63096	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	CYP4F2	P78329	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS2-205	ENST00000558843	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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