RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545250.5

TSC1-208, Transcript of TSC complex subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSC1, Length 8,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1-208ENST00000545250 CEP44Q9C0F1 390 aa9.51□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 STX16O14662 325 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 ATP9BO43861 1147 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 TDP2O95551 362 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 VAV1P15498 845 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 CDH18Q13634 790 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 PTPN3P26045 913 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 KCNB1Q14721 858 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 PROSER1Q86XN7 944 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 POTECB2RU33 542 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 DLG1Q12959 904 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 DOK7Q18PE1 504 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 C12orf60Q5U649 245 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 SLC35F6Q8N357 371 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 24.5
TSC1-208ENST00000545250 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 ZNF302Q9NR11 478 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.5□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 H7C4K7 107 aa9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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TSC1-208ENST00000545250 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.49□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 KIF12Q96FN5 646 aa9.49□□□□□ -0.89
TSC1-208ENST00000545250 SPACA7Q96KW9 195 aa9.49□□□□□ -0.89
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