RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 TANGO2Q6ICL3 276 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 SPATA18Q8TC71 538 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 CGRRF1Q99675 332 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ACBD6Q9BR61 282 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.66■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF202O95125 648 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYL7Q01449 175 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 NHLH1Q02575 133 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TEAD2Q15562 447 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM78AQ5JUQ0 283 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ITIH5Q86UX2 942 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMC8Q8IU68 726 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHKBP1Q8TBC3 707 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 PSMG2Q969U7 264 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ELSPBP1Q96BH3 223 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 STK25O00506 426 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 AOC1P19801 751 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 LHX1P48742 406 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 PTPN5P54829 565 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TCF15Q12870 199 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 SOWAHAQ2M3V2 549 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPH6Q7L8W6 267 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 OSTM1Q86WC4 334 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ASB16Q96NS5 453 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 GPR88Q9GZN0 384 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCTD10Q9H3F6 313 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZFP14Q9HCL3 533 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMLHEQ9NVH6 421 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 MUC6Q6W4X9 2439 aa28.64■■■□□ 2.18
RPS6KA1-212ENST00000526040 A0A1W2PRU2 124 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GABRDO14764 452 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PI15O43692 258 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 CST3P01034 146 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATF6P18850 670 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPYDQ12882 1025 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADGRF2Q8IZF7 708 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 LPIN3Q9BQK8 851 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 DMAC2Q9NW81 257 aa28.63■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PDXKO00764 312 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 RHOBTB3O94955 611 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 RFX1P22670 979 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 FCARP24071 287 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 VEPH1Q14D04 833 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF516Q92618 1163 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SMARCD2Q92925 531 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 TBC1D17Q9HA65 648 aa28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PFKPQ01813 784 aa28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC9A9Q8IVB4 645 aa28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMEM174Q8WUU8 243 aa28.61■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 HCRTO43612 131 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 FGF19O95750 216 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GABRR2P28476 465 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PCSK1P29120 753 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GAREM2Q75VX8 874 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GIPC2Q8TF65 315 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PKMYT1Q99640 499 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PI4K2AQ9BTU6 479 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ATXN3LQ9H3M9 355 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.6■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIF20AO95235 890 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 CASP4P49662 377 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 STARD6P59095 220 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 TAF12Q16514 161 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLEKHO2Q8TD55 490 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHDQ96IW2 340 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 MMS19Q96T76 1030 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 NR3C1P04150 777 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRPC3Q13507 836 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCNB1Q14721 858 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC34Q96HJ3 373 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 TRPV4Q9HBA0 871 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABCB6Q9NP58 842 aa28.58■■■□□ 2.17
RPS6KA1-212ENST00000526040 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA1-212ENST00000526040 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA1-212ENST00000526040 WARSP23381 471 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA1-212ENST00000526040 LMO2P25791 158 aa28.57■■■□□ 2.16
RPS6KA1-212ENST00000526040 VIPR2P41587 438 aa28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms