RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC19Q9H756 370 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DPP3Q9NY33 737 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 AGAP1Q9UPQ3 857 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 BRCA2P51587 3418 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DAPK3O43293 454 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MED7O43513 233 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PSTPIP1O43586 416 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NPTXRO95502 500 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KRT19P08727 400 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GGCXP38435 758 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GUCY2FP51841 1108 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NKX3-2P78367 333 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DR1Q01658 176 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TAP1Q03518 808 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 INCA1Q0VD86 236 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF394Q53GI3 561 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 XKR4Q5GH76 650 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 JAMLQ86YT9 394 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NME8Q8N427 588 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC39CQ8N584 583 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TRPV1Q8NER1 839 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SLCO2A1Q92959 643 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 HPDLQ96IR7 371 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX27Q96L92 541 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SCLT1Q96NL6 688 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 AP5M1Q9H0R1 490 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 FAN1Q9Y2M0 1017 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MGAMO43451 1857 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TREHO43280 583 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KPNA6O60684 536 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GJB6O95452 261 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MYL3P08590 195 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 VDRP11473 427 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 P4HA1P13674 534 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 FNTAP49354 379 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 BEX3Q00994 111 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 OGDHQ02218 1023 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 CNGA2Q16280 664 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 UBXN11Q5T124 520 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC38Q5VT99 294 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NOTUMQ6P988 496 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ERICH1Q86X53 443 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf20Q8ND61 904 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KIF12Q96FN5 646 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 OSMRQ99650 979 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB17Q9H0T7 212 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SNTG2Q9NY99 539 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PSD3Q9NYI0 1048 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MTUS1Q9ULD2 1270 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DOCK3Q8IZD9 2030 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf102A2RUQ5 167 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 O00370 1275 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 PODXLO00592 558 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SH3BP2-209ENST00000504450 MICAL2O94851 1124 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms