RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA18Q8TC71 538 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ACBD6Q9BR61 282 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 LRRC3Q9BY71 257 aa14.67□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 ZNF263O14978 683 aa14.66□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 WDR49Q8IV35 697 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.66□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 USP25Q9UHP3 1055 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 F5P12259 2224 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 KRT85P78386 507 aa14.65□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 POTEHQ6S545 545 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 DPH6Q7L8W6 267 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 HPDLQ96IR7 371 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 ABCB6Q9NP58 842 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 SIX4Q9UIU6 781 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-217ENST00000496015 L1RE1Q9UN81 338 aa14.65□□□□□ -0.06
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ABCD4-217ENST00000496015 CD72P21854 359 aa14.64□□□□□ -0.07
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ABCD4-217ENST00000496015 EHHADHQ08426 723 aa14.64□□□□□ -0.07
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ABCD4-217ENST00000496015 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 GAREM2Q75VX8 874 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 ADGRF2Q8IZF7 708 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 RDH13Q8NBN7 331 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CXorf38Q8TB03 319 aa14.64□□□□□ -0.07
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ABCD4-217ENST00000496015 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.64□□□□□ -0.07
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