RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 PTGFRNQ9P2B2 879 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 CPA4Q9UI42 421 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 MPPED1O15442 326 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV2-14P01704 120 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF134P52741 427 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 CACNA2D1P54289 1103 aa5.22□□□□□ -1.57
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RABGGTB-206ENST00000467748 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
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RABGGTB-206ENST00000467748 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 TTYH3Q9C0H2 523 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGGTB-206ENST00000467748 DKK3Q9UBP4 350 aa5.22□□□□□ -1.57
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RABGGTB-206ENST00000467748 MASP2O00187 686 aa5.21□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 TCF15Q12870 199 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 PTPRRQ15256 657 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC41Q15345 812 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa5.21□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 CDH19Q9H159 772 aa5.21□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 PCSK5Q92824 1860 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.21□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 ITGALP20701 1170 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB1AP62820 205 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF384Q8TF68 577 aa5.2□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 PPM1DO15297 605 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 HTR1BP28222 390 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 CD6P30203 668 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 NXPH1P58417 271 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 RFKQ969G6 155 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-206ENST00000467748 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 KLC4Q9NSK0 619 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 HESX1Q9UBX0 185 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.19□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 UBXN7O94888 489 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 HSPA6P17066 643 aa5.18□□□□□ -1.58
RABGGTB-206ENST00000467748 C21orf58P58505 322 aa5.18□□□□□ -1.58
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