RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP2C2O75185 946 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 ATF6P18850 670 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 TEAD2Q15562 447 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 TMC8Q8IU68 726 aa25.66■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 MMS19Q96T76 1030 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.66■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 TANGO2Q6ICL3 276 aa25.65■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa25.65■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.65■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 KMT2EQ8IZD2 1858 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1W2PRU2 124 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 KRBA1A5PL33 1030 aa25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 PHACTR2O75167 634 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 SRFP11831 508 aa25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM160A1Q05DH4 1040 aa25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 BIRC3Q13489 604 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 NXPE3Q969Y0 559 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.64■■□□□ 1.7
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SH3BP5-208ENST00000459627 MTSS1LQ765P7 747 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 PKMYT1Q99640 499 aa25.63■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 CLSTN1O94985 981 aa25.62■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 FCARP24071 287 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 AVPR2P30518 371 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 ISM2Q6H9L7 571 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.62■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 PSMG2Q969U7 264 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.694e-6■■■■■ 106.6
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SH3BP5-208ENST00000459627 PI15O43692 258 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 VNN1O95497 513 aa25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 CYP2F1P24903 491 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 VIPR2P41587 438 aa25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 NCANO14594 1321 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 AKAP3O75969 853 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF20AO95235 890 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 GABRR2P28476 465 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP5-208ENST00000459627 RAP1GAPP47736 663 aa25.6■■□□□ 1.69
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