RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 POF1BQ8WVV4 589 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PANX2Q96RD6 677 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSWIM1Q9BR11 485 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ELOVL4Q9GZR5 314 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NLRC4Q9NPP4 1024 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 BACE2Q9Y5Z0 518 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO9BQ13459 2157 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 FSCN2O14926 492 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 HUS1O60921 280 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CSPG5O95196 566 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PAEPP09466 180 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCN1P35523 988 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT9P35527 623 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 STAT1P42224 750 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 LHX1P48742 406 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 GLUD2P49448 558 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NDST1P52848 882 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 RAPGEF1Q13905 1077 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMK1Q14012 370 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIN2CQ14957 1233 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM171A1Q5VUB5 890 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 DSTYKQ6XUX3 929 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 Q7L0L9 218 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS52Q8N1B4 723 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 OR10T2Q8NGX3 314 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SPPL3Q8TCT6 385 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TCF25Q9BQ70 676 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ACBD6Q9BR61 282 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TTPALQ9BTX7 342 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBP1Q9H171 429 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 LMCD1Q9NZU5 365 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 MTRRQ9UBK8 725 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NENFQ9UMX5 172 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 IRAK3Q9Y616 596 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 GRM6O15303 877 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 HCRTO43612 131 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSAP10619 480 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 FERP16591 822 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 LMO2P25791 158 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ANXA13P27216 316 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 GSDMDP57764 484 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPN14Q15678 1187 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 USP41Q3LFD5 358 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM171BQ6P995 826 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM270Q6UE05 265 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 METTL23Q86XA0 190 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SPAG5Q96R06 1193 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 MMS19Q96T76 1030 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPRDP23468 1912 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 EPOPA6NHQ4 379 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6C75A6NL08 312 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 H7C4K7 107 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 RFXAPO00287 272 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 O00370 1275 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP26A1O43174 497 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms