RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-208ENST00000427110 TNIP3Q96KP6 325 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-208ENST00000427110 IMPG2Q9BZV3 1241 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRC-208ENST00000427110 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-208ENST00000427110 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.02□□□□□ -1.93
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PTPRC-208ENST00000427110 SLC17A8Q8NDX2 589 aa3.01□□□□□ -1.93
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PTPRC-208ENST00000427110 SMOQ99835 787 aa3□□□□□ -1.93
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PTPRC-208ENST00000427110 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PTPRC-208ENST00000427110 SIK2Q9H0K1 926 aa3□□□□□ -1.93
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