RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420515.1

FAAP20-207, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 1,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-207ENST00000420515 DUSP6Q16828 381 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 VN1R2Q8NFZ6 395 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 IGFLR1Q9H665 355 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 COL6A3P12111 3177 aa29■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 EPHB6O15197 1021 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 LINC01565O15544 149 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 AP5Z1O43299 807 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 KLRC2P26717 231 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 LHX1P48742 406 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 UBR7Q8N806 425 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 WHAMMQ8TF30 809 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SNX25Q9H3E2 840 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 TMLHEQ9NVH6 421 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 IFNKQ9P0W0 207 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 APEX2Q9UBZ4 518 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SPATA31D3P0C874 917 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CLCN4P51793 760 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 NDST1P52848 882 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 INCA1Q0VD86 236 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 THEM5Q8N1Q8 247 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SPATA18Q8TC71 538 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 PKMYT1Q99640 499 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CYP3A43Q9HB55 503 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CISHQ9NSE2 258 aa28.99■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 OR6C75A6NL08 312 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 A8MXQ7 604 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 TGM5O43548 720 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 VNN2O95498 520 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ADH1AP07327 375 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 EPCAMP16422 314 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 NR1I3Q14994 352 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 PGLYRP2Q96PD5 576 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ERGIC2Q96RQ1 377 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ACBD6Q9BR61 282 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CRTAC1Q9NQ79 661 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.98■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CILPO75339 1184 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 NOL4O94818 638 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CPB1P15086 417 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ACO1P21399 889 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 UBASH3AP57075 661 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 GCNT1Q02742 428 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CREMQ03060 361 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 KCNC3Q14003 757 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 RAB33AQ14088 237 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF394Q53GI3 561 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FAXDC2Q96IV6 333 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SYT15Q9BQS2 421 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ELOVL4Q9GZR5 314 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.97■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 MYBPHLA2RUH7 354 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 GLP2RO95838 553 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FAM163BP0C2L3 166 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FILIP1LQ4L180 1135 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 IQCEQ6IPM2 695 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 LILRA6Q6PI73 481 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 GANQ9H2C0 597 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 PPM1EQ8WY54 764 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 CRISPLD1Q9H336 500 aa28.95■■■□□ 2.23
FAAP20-207ENST00000420515 ARHGAP44Q17R89 818 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 ACOT1Q86TX2 421 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 CDH9Q9ULB4 789 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 ABLIM3O94929 683 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 CALCAP01258 141 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 PCSK1P29120 753 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 GPR17Q13304 367 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 TTC9BQ8N6N2 239 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.94■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 MYH10P35580 1976 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 MTMR11A4FU01 709 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 SEC24AO95486 1093 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 GLUD1P00367 558 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 UCHL3P15374 230 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 RAD23BP54727 409 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 TSPY1Q01534 308 aa28.93■■■□□ 2.22
FAAP20-207ENST00000420515 MDH1BQ5I0G3 518 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms