RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 COMTP21964 271 aa22.26■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 C2orf54Q08AI8 447 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 MAMLD1Q13495 774 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 MBTPS1Q14703 1052 aa22.26■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.26■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 CCDC151A5D8V7 595 aa22.25■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 SCN1AP35498 2009 aa22.25■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 TUBBP07437 444 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 KRT35Q92764 455 aa22.24■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 A0A0U1RQF3 1178 aa22.24■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 MICAL2O94851 1124 aa22.24■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.24■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 KRT222Q8N1A0 295 aa22.23■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 C12orf29Q8N999 325 aa22.23■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.22■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.22■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.22■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 HCRTO43612 131 aa22.22■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 ERICH1Q86X53 443 aa22.22■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 L1RE1Q9UN81 338 aa22.22■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 THP07101 528 aa22.21■■□□□ 1.15
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GPC1-202ENST00000420138 ACOT1Q86TX2 421 aa22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 CPXM1Q96SM3 734 aa22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GPC1-202ENST00000420138 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.21■■□□□ 1.15
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