RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	PWWP2A	Q96N64	755 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	NDE1	Q9NXR1	346 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	MYPN	Q86TC9	1320 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PPARG-208	ENST00000397023	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	LYN	P07948	512 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ADRA1D	P25100	572 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CRABP2	P29373	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	GSTT1	P30711	240 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SERPINB4	P48594	390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CDK7	P50613	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TAP1	Q03518	808 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FAM182B	Q5T319	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	LZIC	Q8WZA0	190 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FBXL18	Q96ME1	805 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PAFAH2	Q99487	392 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023		I3L4J1	428 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FAM155B	O75949	473 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ADRB2	P07550	413 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	MAP7	Q14244	749 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RASIP1	Q5U651	963 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF276	Q8N554	614 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	HAPLN3	Q96S86	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	CYTH2	Q99418	400 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PIDD1	Q9HB75	910 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023		A0A1W2PPM1	405 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023		E7ESA3	106 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	LPXN	O60711	386 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	TM7SF2	O76062	418 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	MT-ND3	P03897	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	SERPINB3	P29508	390 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	STAT2	P52630	851 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PPARG-208	ENST00000397023	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79

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