RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 USP44Q9H0E7 712 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RMI1Q9H9A7 625 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 EMC3Q9P0I2 261 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 NARFQ9UHQ1 456 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FADS3Q9Y5Q0 445 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 UNC5CO95185 931 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PSMA3P25788 255 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GRIK1P39086 918 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PDCLQ13371 301 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PNOCQ13519 176 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PRPSAP1Q14558 356 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SLC15A2Q16348 729 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ULK2Q8IYT8 1036 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 VPS39Q96JC1 886 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FAM167AQ96KS9 214 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GLS2Q9UI32 602 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 AK5Q9Y6K8 562 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PDXKO00764 312 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DFNA5O60443 496 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MAGEC1O60732 1142 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PSAPP07602 524 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PEX5P50542 639 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SNAPC2Q13487 334 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ART3Q13508 389 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MICALL2Q8IY33 904 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ALLCQ8N6M5 410 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 HM13Q8TCT9 377 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SERPINB13Q9UIV8 391 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ATP9BO43861 1147 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SNAP25P60880 206 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 VPS72Q15906 364 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GPBP1Q86WP2 473 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SPERTQ8NA61 448 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RDH11Q8TC12 318 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 OTULINQ96BN8 352 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SOX13Q9UN79 622 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 IPPQ9Y573 584 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMEM114B3SHH9 223 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ERBB2P04626 1255 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 VSNL1P62760 191 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZBTB18Q99592 522 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 CGREF1Q99674 301 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ERP44Q9BS26 406 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 EHD3Q9NZN3 535 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 H3BRJ5 948 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 IL1BP01584 269 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TMEM253P0C7T8 217 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SPDYE6P0CI01 402 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MROH9Q5TGP6 573 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 RGS9BPQ6ZS82 235 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRIM59Q8IWR1 403 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 KBTBD8Q8NFY9 601 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 ING2Q9H160 280 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 TRPV5Q9NQA5 729 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 SUN2Q9UH99 717 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRD-203ENST00000381196 MAGEB2O15479 319 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 BMP3P12645 472 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRD-203ENST00000381196 CA4P22748 312 aa5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms