RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 LMO2P25791 158 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 ERVFC1P60507 584 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8FQ08AF8 430 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0319Q5VV43 1072 aa31.55■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 TMC7Q7Z402 723 aa31.55■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 STK33Q9BYT3 514 aa31.55■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 HMGXB4Q9UGU5 601 aa31.55■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 CTSAP10619 480 aa31.54■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 PIK3R5Q8WYR1 880 aa31.54■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 SHC3Q92529 594 aa31.54■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 TCF25Q9BQ70 676 aa31.54■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 RTP3Q9BQQ7 232 aa31.54■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa31.54■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 TRANK1O15050 2925 aa31.54■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 CAMK1Q14012 370 aa31.53■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 THEM5Q8N1Q8 247 aa31.53■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 SPAG5Q96R06 1193 aa31.53■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 GPR88Q9GZN0 384 aa31.53■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa31.53■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 TWNKQ96RR1 684 aa31.53■■■□□ 2.64
ECHS1-201ENST00000368547 F8VZ95 297 aa31.52■■■□□ 2.64
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ECHS1-201ENST00000368547 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
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ECHS1-201ENST00000368547 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa31.51■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM265A0A087WTH1 108 aa31.5■■■□□ 2.63
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ECHS1-201ENST00000368547 PCSK1P29120 753 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
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ECHS1-201ENST00000368547 GPR65Q8IYL9 337 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 ACBD6Q9BR61 282 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 NT5C1AQ9BXI3 368 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 ELOVL4Q9GZR5 314 aa31.5■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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ECHS1-201ENST00000368547 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
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ECHS1-201ENST00000368547 KCND1Q9NSA2 647 aa31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 BACE2Q9Y5Z0 518 aa31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 RAD23BP54727 409 aa31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 MEA1Q16626 185 aa31.49■■■□□ 2.63
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT1Q86TX2 421 aa31.49■■■□□ 2.63
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