RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP40Q9NVE5 1235 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CAPN14A8MX76 684 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 M0R3H8 397 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FFAR2O15552 330 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 LAMTOR5O43504 91 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASNA1O43681 348 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ELANEP08246 267 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDHA1P08559 390 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FGFR4P22455 802 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KLRC1P26715 233 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACVR2AP27037 513 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 NTSR1P30989 418 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCNN1GP51170 649 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RABGGTBP53611 331 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSD11B2P80365 405 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ICA1Q05084 483 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTKQ06187 659 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRT72Q14CN4 511 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB30Q15771 203 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLA1AQ53H76 456 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACHD1Q5VU97 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FCRL6Q6DN72 434 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BORAQ6PGQ7 559 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RNF44Q7L0R7 432 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 DOK3Q7L591 496 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM83AQ86UY5 434 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SP8Q8IXZ3 490 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 LGI4Q8N135 537 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MDGA1Q8NFP4 955 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPM1EQ8WY54 764 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCAMP4Q969E2 229 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPSB4Q96A44 273 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SUCLG2Q96I99 432 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCLT1Q96NL6 688 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 DACT1Q9NYF0 836 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 RRN3Q9NYV6 651 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PNMA2Q9UL42 364 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PADI4Q9UM07 663 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF536O15090 1300 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 AGPSO00116 658 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 NPHP1O15259 732 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 THAP12O43422 761 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 SH3BP5O60239 455 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 USP1O94782 785 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 VNN1O95497 513 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 A1BGP04217 495 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CKBP12277 381 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ALAS1P13196 640 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 HGFP14210 728 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 JUPP14923 745 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 IL1R2P27930 398 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ADORA2AP29274 412 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 GRK6P43250 576 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM189BP81408 668 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 OCA2Q04671 838 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 BIRC3Q13489 604 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZACNQ401N2 412 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms