RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 NME7Q9Y5B8 376 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CYB561D2O14569 222 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF185O15231 689 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 MTA2O94776 668 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CXCR5P32302 372 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 FAAP100Q0VG06 881 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CNGA2Q16280 664 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 UNC93AQ86WB7 457 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CEP112Q8N8E3 955 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 SEPT8Q92599 483 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 SCLYQ96I15 445 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 VCPIP1Q96JH7 1222 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 LHX5Q9H2C1 402 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.8■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 M0QYV0 167 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 O00370 1275 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 HCRTO43612 131 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 FGFR1P11362 822 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 PRLRP16471 622 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 MMP8P22894 467 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CCL23P55773 120 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 PTP4A2Q12974 167 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 RPS6KA1Q15418 735 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 C12orf29Q8N999 325 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 AMFRQ9UKV5 643 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.79■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 PDGFRBP09619 1106 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 COL6A1P12109 1028 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 GJA8P48165 433 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 FAM189BP81408 668 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM4-202ENST00000354241 NT5DC3Q86UY8 548 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM4-202ENST00000354241 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 BTBD6Q96KE9 485 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 KIF4AO95239 1232 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CALB1P05937 261 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 UPP1Q16831 310 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 TET1Q8NFU7 2136 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 COG1Q8WTW3 980 aa21.78■■□□□ 1.08
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TRIM4-202ENST00000354241 ABCB6Q9NP58 842 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 LMO2P25791 158 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 TUSC3Q13454 348 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 UBA3Q8TBC4 463 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 APBB2Q92870 758 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.77■■□□□ 1.08
TRIM4-202ENST00000354241 ENPP3O14638 875 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 CYP2C18P33260 490 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 STILQ15468 1287 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 WSCD1Q658N2 575 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 OSTM1Q86WC4 334 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 URGCPQ8TCY9 931 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 TSC1Q92574 1164 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 ALG6Q9Y672 507 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 SCINQ9Y6U3 715 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 INPPL1O15357 1258 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 TCTN1Q2MV58 587 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.76■■□□□ 1.07
TRIM4-202ENST00000354241 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.76■■□□□ 1.07
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