RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639496.1

KCNQ3-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, human

TSL 5

Gene KCNQ3, Length 4,943 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ3-208	ENST00000639496	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	RBP3	P10745	1247 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	GTF2H1	P32780	548 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MAP2K2	P36507	400 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ITIH5	Q86UX2	942 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TAGAP	Q8N103	731 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PDHX	O00330	501 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT72	Q14CN4	511 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	NCAPH	Q15003	741 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	LINC00523	Q86TU6	105 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.75	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PTPRM	P28827	1452 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	POLB	P06746	335 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	LHX1	P48742	406 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	DPYD	Q12882	1025 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PCSK7	Q16549	785 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	COG1	Q8WTW3	980 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SYCE1L	A8MT33	242 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	NCK2	O43639	380 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ITIH2	P19823	946 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CLCN6	P51797	869 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KIT	P10721	976 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SERPINB4	P48594	390 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CYB561D2	O14569	222 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	VDR	P11473	427 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SREBF1	P36956	1147 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	NAB2	Q15742	525 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MIB1	Q86YT6	1006 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CHST12	Q9NRB3	414 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.74	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	ANGPT2	O15123	496 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MSC	O60682	206 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDH16	O75309	829 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	VCL	P18206	1134 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PTGER2	P43116	358 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	STARD3	Q14849	445 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	MAP3K13	O43283	966 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	CST8	O60676	142 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	TADA3	O75528	432 aa		10.73	□□□□□ -0.69
KCNQ3-208	ENST00000639496	FBXO21	O94952	628 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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