RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 ATICP31939 592 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 MYL6P60660 151 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 MYL7Q01449 175 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 TSPY1Q01534 308 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ENPEPQ07075 957 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ADCY1Q08828 1119 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 NCOA4Q13772 614 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ZNF699Q32M78 642 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ZACNQ401N2 412 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 TTI2Q6NXR4 508 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 SPATA18Q8TC71 538 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 GPT2Q8TD30 523 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 ZNF516Q92618 1163 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 MMS19Q96T76 1030 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 POMKQ9H5K3 350 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NELFE-214ENST00000625905 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CLUHO75153 1309 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 IKBKBO14920 756 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CCL16O15467 120 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 STX10O60499 249 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ABLIM3O94929 683 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 LRG1P02750 347 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 POU2F2P09086 479 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 GCLMP48507 274 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 MXI1P50539 228 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 GPR17Q13304 367 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SV2AQ7L0J3 742 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 RTL10Q7L3V2 364 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 FEZF2Q8TBJ5 459 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CEP63Q96MT8 703 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 TMEM209Q96SK2 561 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 DACH1Q9UI36 760 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 MAFFQ9ULX9 164 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 POLIQ9UNA4 740 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 YIPF1Q9Y548 306 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.89□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 TTC28Q96AY4 2481 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 MTMR11A4FU01 709 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 PAPLNO95428 1278 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 VNN1O95497 513 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 HLA-DRAP01903 254 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 P4HA1P13674 534 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 PCSK1P29120 753 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 GTF2H1P32780 548 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 LHX1P48742 406 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 STX17P56962 302 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 PPP3CAQ08209 521 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 PLD1Q13393 1074 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 UVSSAQ2YD98 709 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 DPH6Q7L8W6 267 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 OSTM1Q86WC4 334 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 GJD3Q8N144 294 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 ELMOD1Q8N336 334 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 MLKLQ8NB16 471 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SNX25Q9H3E2 840 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.88□□□□□ -0.83
NELFE-214ENST00000625905 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms