RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	MCTP1	Q6DN14	999 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	JADE1	Q6IE81	842 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	YAF2	Q8IY57	180 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	E2F7	Q96AV8	911 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SENP8	Q96LD8	212 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	RTKN	Q9BST9	563 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	IL21	Q9HBE4	155 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		12.96	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0B4J269	797 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ENM7	598 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	OGT	O15294	1046 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT37	O76014	449 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	RET	P07949	1114 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ODC1	P11926	461 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF131	P52739	623 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CCIN	Q13939	588 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC32	Q14392	662 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PON2	Q15165	354 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR158	Q5T848	1215 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		12.95	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMA1	P25391	3075 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YCG3	227 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PIR	O00625	290 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF9	O60383	454 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIN1	Q05586	938 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CHFR	Q96EP1	664 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB3	Q9Y575	518 aa		12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A4	O14863	429 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP3	O75074	770 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP11A1	P05108	521 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRB1	P08588	477 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	KYAT1	Q16773	422 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	MYCT1	Q8N699	235 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	STKLD1	Q8NE28	680 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	RIN3	Q8TB24	985 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	NETO1	Q8TDF5	533 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PARVG	Q9HBI0	331 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	OBP2A	Q9NY56	170 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		12.93	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	DPYSL4	O14531	572 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	EXTL3	O43909	919 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAK2	O60296	914 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM13A	O94988	1023 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCG1	P19174	1290 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOT2	P49753	483 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	MCM6	Q14566	821 aa		12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
TTLL3-233	ENST00000602338	CSRP2	Q16527	193 aa		12.92	□□□□□ -0.34

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