RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CCP110O43303 1012 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ASNA1O43681 348 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SOAT2O75908 522 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM155BO75949 473 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HAUS5O94927 633 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GLP2RO95838 553 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CD4P01730 458 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 POLBP06746 335 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CKMT1AP12532 417 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF28P17035 718 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 EGR1P18146 543 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CAPN3P20807 821 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 IL13P35225 146 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GZMKP49863 264 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CDR1P51861 262 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 UCP3P55916 312 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 WNT3P56703 355 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 BPIFB4P59827 614 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM110CQ1W6H9 321 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PRR31Q5SQ13 230 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 AGBL4Q5VU57 503 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CFAP161Q6P656 301 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MZB1Q8WU39 189 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 THAP4Q8WY91 577 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SCAMP4Q969E2 229 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 AJUBAQ96IF1 538 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NDC1Q9BTX1 674 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MRI1Q9BV20 369 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNH6Q9H252 994 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 GGA3Q9NZ52 723 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.16□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A087WZ62 844 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 DYTNA2CJ06 578 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF785A8K8V0 405 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PRSS47A8MTI9 375 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM233B4DJY2 109 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 WNT10BO00744 389 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SASH1O94885 1247 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 AMHP03971 560 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CYP2C9P11712 490 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NPPBP16860 134 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CNTFP26441 200 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ADD2P35612 726 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CASRP41180 1078 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NCKAP1LP55160 1127 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC29A2Q14542 456 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNMB1Q16558 191 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF280DQ6N043 979 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 Q6ZUG5 572 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 HERVK_113Q902F9 699 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NUDT11Q96G61 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 CEP95Q96GE4 821 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 NOX5Q96PH1 765 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 VPS45Q9NRW7 570 aa6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 A6NLC8 198 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 B4E171 279 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 B5MCH6 92 aa6.14□□□□□ -1.43
PIK3C3-211ENST00000589550 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms