RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF180Q9UJW8 692 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 DMTF1Q9Y222 760 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 PLAAQ9Y263 795 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 WDR37Q9Y2I8 494 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRM-204ENST00000577468 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 CD4P01730 458 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MT-ND3P03897 115 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 TPM1P09493 284 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PHKG2P15735 406 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 CCT8P50990 548 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 GRIK3Q13003 919 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPS2Q13227 327 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TCEA2Q15560 299 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IPMKQ8NFU5 416 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO30Q8TB52 745 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 OR14A2Q96R54 314 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRM-204ENST00000577468 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.33□□□□□ -1.88
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